本实用新型公开了一种菌群检测运输用车载冰箱，属于菌群检测技术领域，该菌群检测运输用车载冰箱，包括箱体，所述箱体上设置有容纳槽一、容纳槽二，且内部均设置一次性容纳袋，所述容纳槽一的开口处设置有台阶，且所述台阶上设置有磁吸卡条，所述容纳槽一中设置有分隔架，所述容纳槽二上可拆卸安装有限位架一，所述限位架一的底部设置有承托架一，所述限位架一包括板体，所述板体的两侧设置有限位块一。通过在容纳槽一和容纳槽二中放置一次性的袋子如塑料袋，避免试样破损污染冰箱，通过磁吸卡条用以固定袋子的边缘，而容纳槽二中，通过可拆卸的限位架一、承托架一、限位架二等可拆卸的部件进行固定，将容纳槽二内部构件拆除后仍可作为正常的车载冰箱使用。