一种基于自动化定点作业的水上清淤平台，包括可拼装船体、导航定位控制装置和底泥清淤扰动运输装置；导航定位控制装置包括锚固桩、牵引设备、导航定位器和控制柜，底泥清淤扰动运输装置包括移动式吊装机构、底泥扰动射流装置和柔性排沙装置，吊装机构设置在可拼装船体上，吊装机构通过钢丝绳吊挂住底泥扰动射流装置，柔性排沙装置的进口与底泥扰动射流装置连接。本实用新型解决了清淤作业中清淤区域规划、清淤位置定位、清淤深度测控问题，通过模块化的船箱拼接能够实现平台预制和便捷运输；通过控制模块实现清淤区域的自动化移动和定点清淤作业，有效提高了清淤排沙作业效率，大幅度降低了清淤成本。