本实用新型公开了一种畜牧兽医用防疫隔离装置，包括底座，底座顶部右侧固定安装有隔离槽，隔离槽底部滑动安装有抽槽，隔离槽固定安装有铁网，隔离槽前端固定安装有隔离玻璃，隔离玻璃前端固定安装有合页，合页活动安装有玻璃门，隔离槽内部上端右侧固定安装有紫外灯一，底座右侧顶端连通有进风管，进风管内部从左往右依次固定安装有隔离网一、紫外灯二、隔离网二和进气扇，隔离槽右侧连通有排气管，排气管内部固定安装有三组紫外灯三和三组电热网，排气管出口处固定安装有排气扇。本实用新型通过隔离槽内部的空气经排气管排出，通过较长排气管内的三组电热网和三组紫外灯可以将细菌杀死排出，增加隔离槽内空气的流动性有利于减缓动物的病情。