本实用新型属于水质监测设备技术领域，提供了一种高安全性的水质自动采样设备，包括主机部和存储部，主机部包括主机外壳，设置在主机外壳上表面的显示屏，内置于主机外壳内的电路控制模块，以及微型泵和连接水管，电路控制模块通过电路保护罩罩住；存储部包括存储外壳，内置于存储外壳内的采样部和位于采样部下方的废液存储桶；主机部和存储部之间设置有塑料隔板，连接水管穿过塑料隔板与存储部连接。本实用新型中主机部和存储部层叠设置，且主机部和存储部之间采用塑料隔板隔开，同时，对设备的电路部分重点防护，电路控制模块采用电路保护罩罩住，隔绝电路控制模块与水接触，由此实现设备的水电分离，从而杜绝了安全隐患。