本实用新型涉及药物提取技术领域，公开了一种水浴式药物提取分离装置，包括水浴箱，所述水浴箱的上侧设置有药物放置机构，所述药物放置机构包括上盖和药物盒，所述上盖包括上盖本体、支撑架和封挡板，所述上盖本体的下侧设置有密封盖，所述上盖本体的上侧开设有一组卡槽，所述上盖本体的上侧位于卡槽的两侧均设置有导向杆。本实用新型通过将药物放在药物盒的内侧，再将药物盒分别放入若干个药物卡槽内，再将封挡板滑动卡钳在支撑架的中间，将一组定位块在导向杆上滑动，可使得支撑架在卡槽内上下移动，通过转动螺帽可使得定位块的位置被固定，方便工作人员根据水位进行操作，通过限位环可以起到限位作用。