本实用新型公开了医疗器具清洗消毒分拣运送装置，包括传送机构，所述传送机构的顶端依次设置有第一喷淋清洗箱、喷淋消毒箱、第二喷淋清洗箱、高温消毒箱和降温烘干箱，所述第一喷淋清洗箱、第二喷淋清洗箱和喷淋消毒箱后侧底端中部分别设置有水泵。本实用新型中，通过红外感应装置操控对单个手术器具进行喷淋清洗、喷淋消毒、喷淋清洗、高温消毒和降温烘干等消毒过程，一次喷淋清洗，清洗掉污渍、一次喷淋消毒、二次喷淋清洗，清洗掉残余消毒液、二次高温消毒对器具进行高温蒸汽蒸煮、降温烘干，整个流程的自动化实现流水线单个消毒以及无人车运送的智能化，从而使得医疗器具运输中不会存在二次污染的风险。