本实用新型公开了细胞磁珠流式分选装置，包括分选管道和底板，所述分选管道位于底板的上方，所述底板顶部设有夹紧圆盘和滑动板，所述滑动板上连接有两个对称设置的调控板，所述夹紧圆盘上设有两个夹紧轴，所述夹紧圆盘的中心处设有与分选管道相对应的连通口。本实用新型通过夹紧圆盘、调控板和磁吸块的配合使用，将磁吸块安装在分选管道的上下两侧，使得分选管道内的细胞混合物在磁性的作用下分离，由此可以完成细胞的分选，并且在对不同细胞的混合物进行分选时，通过人工手动转动夹紧圆盘，使得两个磁吸块能够相对或相背运动，进而可以依据细胞特性改变与分选管道之间的距离，提高了装置的实用性。