本实用新型公开了一种多肽自组装实验装置，属于多肽实验装置技术领域，包括实验箱，实验箱内安装有两个反应仓，两个反应仓的顶部均贯穿实验箱的上端面并延伸至实验箱的外部，反应仓的外侧壁与实验箱的外侧壁滑动连接，反应仓外侧壁的顶部贯穿安装有PH探头，反应仓的底端面开设有安装槽，从而使用该装置进行多肽试验时，为方便观察实验调节反应仓的高度，启动两个第二电机，使得转动杆的一端向上移动将升降板进行抬升，进而使两个反应仓移动至实验箱的外部，便于工作人员观察实验状况且两个反应仓可同时进行两组实验，操作简单且便于使用，进行多肽自组装实验时，对PH、温度要求高，在一个装置中实现两个条件同时精确控制，有利于自组装的研究。