本实用新型公开了一种微生物萃取液离心式分离装置，包括底座，所述底座的顶部固定安装有隔板，所述隔板的顶部固定安装有机壳，所述机壳的顶部安装有可转动的进料管，所述底座的内部活动安装有分离器，所述分离器的外侧固定安装有环形分布的分水板，所述隔板的内部固定安装有位于相邻两个分水板之间的第一电磁阀，所述隔板的顶部固定安装有位于分离器底部的内座，所述内座的内部固定安装有第二电磁阀。该微生物萃取液离心式分离装置，具有连续性工作、提高效率的优点，解决了离心机不能够随时将沉降速度快的液体进行排放，需人工进行清理，并且是间歇式的工作，无法实现连续性不间断的分离处理，分离效率受到了局限。