本实用新型涉及生物反应器技术领域，公开了一种藻类微生物光合反应系统，包括控制器、养殖容器、调节罐、储酸罐、储碱罐以及储水罐，养殖容器设有进水口和出水口，调节罐设有输出口和输入口，出水口通过第一输送泵与输入口连接，输出口通过第二输送泵与进水口连接，储酸罐通过酸输送泵与调节罐连接，储碱罐通过碱输送泵与调节罐连接，储水罐通过水输送泵与调节罐连接，养殖容器内设有第一pH传感器，调节罐内设有第二pH传感器，第一pH传感器、第二pH传感器、酸输送泵、碱输送泵、水输送泵、第一输送泵和第二输送泵分别与控制器电性连接。本实用新型能使养殖容器内的pH值保持在适宜范围，有助于藻类微生物光合作用。