本实用新型提供一种汽车侧门导轨密封护套及其装配结构，所述密封护套包括头部护套和尾部护套，头部护套的一端与尾部护套的一端连接，从而连接成L型护套；头部护套的两侧分别设有外端盖和内端盖，尾部护套的一侧设有密封舌片；本实用新型提供的汽车侧门导轨密封护套，能够解决玻璃导轨及上支架区域容易出现的密封不良问题，具遮蔽玻璃导轨端头和密封的双重功能，从根本上解决了玻璃导轨上支架密封不良的问题，而且装配更加容易，可以实现免胶装配；具有结构简单、稳定可靠、密封严实，装配方便的特点。