本实用新型涉及水生态技术领域，具体揭示了一种水生态修复深层取样装置，包括支架，所述支架的顶部固定连接有顶板，所述顶板顶部的中心处固定连接有调节气缸，所述调节气缸的输出端固定连接有移动座，所述移动座的底部固定连接有伺服电机，所述伺服电机的输出端固定连接有转轴，所述转轴的表面固定连接有螺旋叶，所述转轴的底部安装有取样筒，取样筒内腔前侧的底部开设有取样孔。本实用新型通过抽水泵的工作使抽水管对水源进行抽取，然后通过抽水泵传递至排水管的内部，通过排水管传递至喷头的内部，通过喷头喷向至螺旋叶的表面，达到了清洗功能的优点，解决了现有的水生态修复深层取样装置在使用时不具备清洗功能的问题。