本实用新型公开了藜麦种子包衣机，涉及包衣机技术领域。本实用新型包括壳体，壳体顶部相对两侧分别固定设置有储料筒以及进料斗，且储料筒与进料斗均与壳体内部相连通，壳体内部及左侧设置有清理机构，清理机构包括清理箱、筛板、第一电机以及凸轮，清理箱固定设置于壳体内部左侧上端位置，清理组件右侧设置有包衣机构，包衣机构包括传动组件、转杆、搅拌轴以及喷洒组件，传动组件设置于壳体上部，且传动组件位于储料筒后侧。本实用新型通过设置清理机构与包衣机构，将种子与其内部含有的尘土与碎屑进行分离，减少了作业工序，降低了设备成本或者人工成本，使藜麦种子表面包衣剂涂抹均匀，处理效果好，提高了产量。