本实用新型涉及水体取样技术领域，且公开了一种全自动水质检测系统，包括取样箱，取样箱顶部固定连接有固定板，固定板设置有两组，两组固定板之间设置有取样机构，取样箱顶部设置有过滤机构。该全自动水质检测系统，通过释放与第二连接件固定的吊钩将取样箱沉入水中，取样箱底部可以存放增重物体，当取样箱沉入到较深水域时，将与第一连接件固定的吊钩向上拉动，使第一连接件带动固定块、支撑杆和限位柱同步向上移动，活动槽内的支撑杆向上移动一段距离后被限位块限位，限位柱向上移动一端距离后下端开设的进水槽伸出取样箱外部，通过进水槽将水体引入到取样箱内部进行取样，通过这种取样方式，解决了人工下潜到较深区域取样过于危险的问题。