本实用新型公开了微型专用特种高压发生器控制调试系统，包括下箱体，所述下箱体顶端转动连接有上箱体，所述下箱体和上箱体相互远离的一侧均设置有把手，所述下箱体内部设置有调试部件；通过设置下箱体，下箱体内部设置有调试部件，将下箱体和上箱体通过把手提起，然后将下箱体放在某个平面上，打开下箱体顶端的上箱体，将微型专用特种高压发生器接入调试部件后进行控制调试，调试结束后将上箱体合上，通过把手将下箱体和上箱体提起，进而便于进行携带和移动使用，提高了调试系统的实用性。