本实用新型公开了一种冷藏车厢密封结构，包括箱体，所述箱体的两侧均转动连接有门板，所述门板上安装有密封垫，两个门板相互靠近的一侧均设有密封机构，所述密封机构与箱体传动连接，所述箱体的顶部内壁上固定安装有两个对称设置的固定盒，两个固定盒之间转动连接有同一个转杆，两个固定盒中的一个固定盒的一侧固定安装有电机，所述电机的输出轴与转杆固定连接，所述固定盒上设有传动机构，所述传动机构与门板传动连接，所述密封机构包括放置槽，放置槽开设在门板的一侧，且放置槽内滑动连接有顶板。其具有结构简单，操作方便，能够便于自动的对门板进行开关，同时还能对门板进行密封，便于冷藏车厢的保温。