本公开涉及一种手机指纹段差测量装置，包括底座和支架，底座上具有容置腔，支架的几何中心与容置在容置腔内移动终端的指纹位的几何中心位于同一竖线上，支架具有检测装置，检测装置包括两个相对设置的检测结构，两个检测结构能够朝向相互远离或者相互靠近的方向移动，检测结构具有两个探头，各检测结构滑动至第一预设位置时，其中一个探头可测量指纹位的第一高度，其中另一个探头可测量电池盖的第二高度，以根据其中一个检测结构测量出的第一高度和第二高度之间的第一高度差与其中另一个检测结构测量出的第二高度差之间的差值确定指纹位的水平度，有效避免了指纹位划伤或变形，不受操作者技能水平影响，测量精度高。