本实用新型给出了一种瓶装眼药水辅助装盒机构；包括推动组件、瓶装眼药水输送机构、堆积盘和装盒输送机构；推动组件包括推动气缸、移动座和推动杆，推动杆近端固定在移动座上，推动杆开有出气孔，推动气缸的活塞杆端部与移动座连接；瓶装眼药水输送机构设有间隔皮带，推动杆远端对准处于间隔皮带上侧区域；堆积盘的进口的位置对准推动组件的推动杆远端，堆积区域底部设有安装槽；装盒输送机构具有传输带，上部的传输带构成输送通道。推动杆带动瓶装眼药水直至瓶装眼药水进入堆积盘中，高压气体从推动杆喷出，推动杆带动瓶装眼药水移动至堆积盘内，装盒输送机构一次性将堆积盘中的所有瓶装眼药水全部从堆积盘的出口转移至包装盒内。