本发明公开了一种抗菌玻璃盖板及其制备方法，包括盖板本体，盖板本体包括玻璃板、挡水框和若干个抗菌机构，玻璃板的外侧套设有挡水框，玻璃板的表面开设有若干个安装槽，若干个安装槽的内部均卡合安装有抗菌机构，玻璃板包括抗指纹膜层和防护机构，抗指纹膜层的一侧固定安装有防护机构，防护机构包括竹炭层、防静电层和杀菌层，防静电层远离竹炭层的一侧固定安装有杀菌层，本发明通过先在盖板本体内加入抗菌纳米银处理剂，提高盖板本体的抗菌性能，再通过抗指纹膜的设备进行喷涂作业，在原有的抗菌基础上增加抗指纹膜的特性，达到了一次喷涂作业两种性能双重产品效果，生产良率高，制程损耗低。