本发明公开一种凹凸棒石基有序微孔沸石催化剂及其制备方法与应用，催化剂以凹凸棒石基有序微孔沸石为壳层，以镍、钴为活性金属内核，镍的含量为5～15wt％，锰的含量为0.1～3wt％。本发明催化剂采用镍钴作为活性组分，可增强催化剂裂解甲烷C‑H键的能力；金属钴通过与镍形成合金或尖晶石结构、在催化剂表面构建氧缺陷位点，可增强对金属镍的锚定能力、促进催化剂表面积炭前驱体的氧化移除，从而增强催化剂抗积炭能力。本发明所述催化剂相对于其他镍基催化剂，通过将凹凸棒石基硅源与金属乙二胺络合物共水热结晶，可同步将金属颗粒限域在凹凸棒石基沸石的微孔孔道中，从而限制金属颗粒的增长，提升催化剂抗活性组分烧结能力。