本发明涉及一种高通量混凝絮凝实验系统及实验方法，包括多组透明沉降槽，多组透明沉降槽依次成列放置在摄像机前端，距离摄像机最远的透明沉降槽上印制有刻度线；多组透明沉降槽的远离摄像机一侧设置有平行光源发射器；多组透明沉降槽的加注端均安装有四通阀，四通阀的一端通过药剂变频高通量计量泵与药剂搅动箱连接，多组透明沉降槽分别对应药剂搅动箱的一个内腔；料浆变频高通量定量给料泵安装于料浆制备槽和四通阀之间。摄像机、药剂变频高通量计量泵、料浆制备槽和料浆变频高通量定量给料泵、药剂搅动箱、平行光源发射器与控制计算机电连接。本发明具备无人为干扰因素沉降实验的优点，解决了现有沉降实验人为误差大、实验结果因人而异的问题。