本发明公开了一种适用于闸站结合的Y形沉降式导流墩，包括长直体段、第一圆弧体段和第二圆弧体段，第一圆弧体段和第二圆弧体段相对设置并与长直体段拼接形成Y形结构；Y形沉降式导流墩布置于闸站结合中水闸和泵站的联结处，长直体段与水闸和泵站联结处的闸墩相连接，第一圆弧体段位于水闸侧，第二圆弧体段位于泵站侧；第一圆弧体段和第二圆弧体段分别由底部的液压式升降台支撑，泵站单独运行是控制液压式升降台将第二圆弧体段下沉于水闸和泵站基础之下，水闸单独运行时控制液压式升降台将第一圆弧体段下沉于水闸和泵站基础之下。本发明的Y形沉降式导流墩通过隔绝回流，优化了边壁的进水条件，进而改善了闸站结合工程的进水情况。