本发明公开了一种纳米生物活性玻璃水凝胶复合材料及其制备方法。该复合材料以琼脂糖－黄原胶水凝胶为载体，在琼脂糖－黄原胶水凝胶三维网络结构内负载有纳米生物活性玻璃材料。上述复合材料的制备方法，包括三个步骤：纳米生物活性玻璃材料的制备、琼脂糖－黄原胶水凝胶的制备以及生物活性玻璃水凝胶复合材料的制备。本发明通过琼脂糖－黄原胶水凝胶负载纳米生物活性玻璃，制备得到的复合材料具有改善的粘度和功能，可以在牙齿表面持续滞留提供稳定的矿物离子释放，且不改变纳米生物活性玻璃本身的活性。