本发明提供一种铁路安全计算机平台通信板卡配置管理方法及系统，方法包括：辅助控制模块与主控制模块通信，以判断满足第一条件时，将配置信息发送到通信模块；所述通信模块用于根据所述配置信息进行自身的参数配置，并根据参数配置运行，以为主控制模块提供通信数据。分离部署配置文件，引入非安全的辅助控制模块协助主控制模块分发、管理各类通信板卡配置数据，减少主控制模块中安全逻辑单元中的非安全功能，减少主控制模块维护通信板卡配置的功能，提高安全性和主控制模块的处理效率，便于各模块板卡独立发布。