水上液压传动系统、控制方法及包括该系统的水陆两栖车，包括变量泵、主控制液压阀、定量马达、电磁换向阀、控制器、电控手柄；变量泵与发动机自由端连接，将机械能转化为液压能，通过主控制液压阀和定量马达将液压能转化为机械能传递至对称布置在车体尾部的两个水上推进装置并使其运转；控制器利用电液比例控制方式控制主控制液压阀的换向，改变阀芯开口量大小即控制进入定量马达的流量大小；控制器控制产生的反馈信号传至变量泵使其根据反馈信号动态调节自身的排量。本发明采用电液比例控制技术，确保操作简单方便和精确控制；由控制器对各执行机构的动作进行逻辑控制，保证协调性和安全性；通过总线技术与车辆信息系统通讯，实现人机交互。