本发明公开了一种深部难采煤层碳资源高效利用与二次封存方法，所述方法包括：由地面向难开采煤层打深钻孔，同时对煤层进行取样；测试取样样品的透气性、瓦斯含量以及对二氧化碳和瓦斯吸附性的差异性，确定地面钻孔的位置、钻孔间距与钻孔深度；利用钻孔抽采所测试煤层的瓦斯；将抽采的瓦斯进行燃烧发电，产生的能量为抽采过程和注液过程提供动力；对瓦斯燃烧产生的二氧化碳进行收集，并进行低温高压压缩处理，得到液态的二氧化碳，伴随气态混合成超临界二氧化碳；利用无缝钢管将超临界二氧化碳通过钻孔注入到煤层；撤出无缝钢管，对钻孔进行永久封孔。上述全过程处于封闭状态，通过单一钻孔实现对深部难采煤层区域碳资源的高效利用与二次封存。