本发明公开了一种装盒整理机构，包括活动轨道；安装座，至少部分可沿活动轨道滑行；折叠单元，设于相邻的安装座之间，具有折叠状态和展开状态，当处于展开状态时，至少两版包装物可错位放置在折叠单元上，且包装物的型腔所在面朝下；当安装座相互靠近时，折叠单元从展开状态转换至折叠状态，以将相邻两版包装物竖直叠放，且包装物的型腔所在面相正对、型腔相互错位。本发明还公开了一种装盒装置和装盒整理方法。本发明以两个包装物为一组进行扣合整理，整理快速、有效；在包装物竖直扣合时，型腔就实现了错位、首尾相扣叠放，特别适合包装物型腔两端大小不一致，需要反向倒扣节约空间的场合；整体布局紧凑、简单，占用空间小。