本发明公开了一种基于数据分析的药物警戒数据更新系统及方法，属于医疗技术领域。本发明包括以下步骤：步骤一：获取个例安全性报告，按照不良反应类型对个例安全性报告进行分类处理，个例安全性报告内容包括确定的患者、确定的报告者、确定的不良反应事件和确定的怀疑药物；步骤二：对分类处理后的个例安全性报告中各药物警戒数据的有效性进行判断，根据判断结果将无效个例安全性报告进行剔除；步骤三：对步骤二中留下的个例安全性报告中的药物警戒数据和不良反应类型进行记录，整理成数据集；步骤四：将步骤三得到的数据集与数据库进行匹配识别，根据匹配识别结果对数据库中的药物警戒数据和药物警戒数据对应的不良反应类型进行更新。