本发明公开一种实蝇诱捕分析系统和识别方法，包括相互连通的捕捉通道、拍摄仓以及收集仓，捕捉通道与拍摄仓之间以及拍摄仓与收集仓之间设置自动启闭的仓门，捕捉通道与外界连通实现实蝇的诱捕，实蝇通过捕捉通道进入拍摄仓内，捕捉仓门自动关闭，且感应器启动拍摄装置，拍摄仓实现实蝇图像采集，并将图像上传至分析系统进行识别；拍摄完毕，收集仓自动开启收集仓门收集拍摄完毕的实蝇；所述分析系统实现对诱捕器的控制并进行实蝇的物种识别。本发明可将采集高清、噪点少的实蝇图像，并实时上传至分析系统，分析系统分析实蝇的物种信息，且分析系统统一控制诱捕装置工作，实现定位、参数设定、实时监控等功能。