本发明公开了一种传染病房隔离式空调风向控制装置及控制方法，具体涉及医疗空调通风设备技术领域，包括第一机壳，所述第一机壳的顶部设置有与第一机壳相连通的第二机壳，所述第一机壳的内部设置有消毒过滤组件，所述第一机壳和第二机壳的连通处设置有防回风组件。本发明通过各个结构的相应配合使用，避免气流外泄以及回流，同时确保气流能够输送至病房的各个区域，以及各个病房各个区域内的空气能够被抽取，确保混杂有消毒液的气流能够输送至病房不同的区域内，对空气进行多层次过滤，避免空气内混杂的病毒被排出，通风空调系统简单，能源消耗低，空调风向方便控制，避免污染气体内外交换。