本发明提供轨道交通列控车载设备模拟电路级健康度预测方法及系统，属于轨道交通运行控制技术领域，基于车载设备模拟电路功能原理图，建立电路分析仿真模型；根据电路分析仿真模型，获取电压相应信号的时域特征；将电路在各个元件处于标称值时运行得到的特征数据集作为健康状态数据集；计算待测样本特征数据集与健康状态数据集之间的敏感度为样本特征权值；计算待测样本与健康样本之间的加权马氏距离作为待测电路的健康度；将一段时间内样本健康度作为预测模型的输入预测下一时间段电路的健康度的值。本发明有效利用原始输出电压数据时域中的有效信息，通过预测电路下一时间节点的健康度，判断电路健康状态，为模拟电路级维修活动提供指导帮助。