本发明提供了一种适用于医疗器械消毒的等离子体灭菌袋和使用方法，每个柔性电极通过两组金属按扣固定在密封袋内侧，电源接口穿过密封袋与金属按扣相连，柔性电极包括依次连接的第一绝缘介质、第一金属电极、第二金属电极、第二绝缘介质、铜片和第三绝缘介质，第一金属电极为高压金属电极，第二金属电极和铜片组成低压金属电极，高压金属条和低压金属条之间均匀交错布置，铜片覆盖高压金属条和低压金属条交错的部分。本发明提出的等离子体灭菌袋具有密封和便携的特性，能在不同场景下实现对医疗器械的高效灭菌。并且由于灭菌过程始终处于密封环境，确保在灭菌结束后，医疗器械在运输的过程中不会造成二次感染。