本发明公开了一种感染性医疗废物智能消毒器及其使用方法，智能消毒器包括主壳体，主壳体的一侧设置有悬挂装置，悬挂装置的一侧固定安装有一对雾化喷头，主壳体的底端设置有一对连接孔，连接孔的内部均安装有连接头，主壳体的底端设有一对药剂瓶，药剂瓶的顶端均设置有螺纹口，且药剂瓶均能通过其顶端的螺纹口与连接头连接，主壳体的内部安装有微型泵机，微型泵机的输入和输出端分别连接有进液管和连接软管。该种感染性医疗废物智能消毒器，通过雾化喷头与微型泵机的配合使用，可实现自动向垃圾桶内喷洒高效消毒剂，以实现对垃圾桶内细菌的有效抑制，进而可有效防止垃圾桶内部的细菌病毒随气流溢散到空间，给医务及病患带来二次感染的情况出现。