本发明提供一种码头无人值守智慧边检亭装置及其作业管控方法。智慧边检亭装置包括对称布置在智慧边检亭左右墙体上的两组双折门、对称布置在智慧边检亭前后墙体上的两个单折门、布置在智慧边检亭内部的三辊闸机与摄像头，每组双折门包含三层折叠门；三辊闸机支持多种类型证件识别，用于控制人员双向进出智慧边检亭，双折门的外侧设有用于连接船梯和边检亭的跳板，跳板上设置有插装式护栏，形成专用通道以方便人员离开和进入船舶。本发明将船梯、边检亭入口等区域形成封闭空间，指定唯一进出通道，对人员进出边检亭和船舶进行管控，能够利用信息读取、人脸识别和数据库比对在内的先进技术实现边检自动化作业，提高码头边检效率，防止偷渡等不法现象发生。