本发明提供一种新型河道淤泥综合治理生态修复装置及其施工方法，包括横梁，所述横梁的两端均固定有移动板，横梁的底部两侧安装有可上下移动的截断板，两个所述截断板平行设置，所述横梁的前侧固定有三角形导流板，横梁的左右两侧设有水流通道，横梁上设有淤泥槽，所述水流通道前侧安装有电动闸，水流通道的两侧均固定有固定板，两个所述固定板之间转动连接有转轴，所述转轴上安装有叶轮，所述淤泥槽的两侧均固定有安装板，两个所述安装板之间转动连接有转杆。该修复装置可在不影响河道水流的情况下，分段式的将淤泥抽出进行处理后再泵回河道底部，修复过程简单有效，并且能够自动的对将淤泥与分解剂和微生物搅拌，修复效果好。