一种柳兰水提物中获得月见草素B有效部位方法及应用，属于柳兰有效成分提取与应用技术领域。对柳兰全草依次进行乙醇水溶液回流提取、浓缩、干燥获得浸膏，浸膏经蒸馏水分散后依次采用乙酸乙酯萃取和异丁醇萃取，经两轮萃取后的剩余浸膏浓缩、干燥获得柳兰月见草素B有效部位，通过对柳兰乙醇水溶液的粗萃取，分离出乙酸乙酯有效部位与异丁醇有效部位后，将剩余的成分作为柳兰月见草素B有效部位，该部分未经过石油醚接触，月见草素B含量高，并且其中至少包含一种能够对月见草素B有显著增效作用的成分，两特征相辅相成，获得的月见草素B有效部位具有显著的调节免疫系统作用。