本发明公开了蓝芩漱口水的制备及用途，制备方法包括以下步骤：步骤1：制取板蓝根提取物、黄芩提取物、黄柏提取物、栀子提取物和胖大海提取物；步骤2：将一定量的右旋糖酐酶、溶菌酶、氢氧化钠、羧甲基纤维素钠、亚氯酸钠、苯甲酸钠、碳酸氢钠、水混合制得溶液；步骤3：称量步骤1中提取物加入到步骤2的溶液中，搅拌并离心；步骤4：吸取上清液透析，最后灭菌，即得抗菌漱口水；蓝芩漱口水的用途，在制备具有美白抑菌效果的口腔用制剂中的用途；制备的漱口水对牙周炎、牙龈炎、口腔溃疡、牙菌斑、牙出血、口臭等有致病菌引起的不适起到缓解作用，且安全无毒、无刺激，无副作用，同时显著提高了漱口水在防治牙龈出血上的疗效。