本发明公开了基于自动装盒机的自动合盖机构，涉及智能药机领域，包括机架，所述机架上滑动连接有下压板，所述下压板上设置有翻转板，所述下压板在下压行程中向下移动以对包装盒的折边进行下压，在下压行程中，所述下压板通过翻转组件驱动翻转板运动以对包装盒的折边在下压后进行翻转，以实现对包装盒进行合盖。本发明提供的基于自动装盒机的自动合盖机构，通过下压板在机架上向下滑动，使下压板在向下滑动的过程中带动翻转板发生转动，使翻转板发生转动对包装盒进行折边，进而在下压板向下移动的过程中对包装装盒的折边进行扣接时带动翻转板转动实现以对包装盒进行合盖。