本发明公开了一种高性能水性聚氨酯胶粘剂及其制备方法，包括以下重量份数的组分：聚己二酸新戊二醇酯多元醇8～20份、聚己二酸己二醇酯多元醇25～50份、聚四氢呋喃醚二醇7.8～16份、异氟尔酮二异氰酸酯5～14份、三羟甲基丙烷3～4份、1,4‑丁二醇4～6份、二羟甲基丙烷7～9份、三乙胺6～7份、去离子水25～50份、催化剂0.2～0.3份、溶剂3～20份和异氰酸酯固化剂6～7份；本发明通过缩聚的方法可得到粘接强度高，耐水，耐湿热性能比较优异的水性聚氨酯胶粘剂，并且本发明的水性聚氨酯胶粘剂还具有很好的力学性能，配合相关工艺，可直接应用于生产实际中。