本发明提供了一种海水冷却机组凝汽器加药除贝在线清洗装置，包括药液供应装置、供液管路、驱动装置、管口刮贝机构和换热管喷洗机构，所述药液供应装置通过所述供液管路向所述换热管喷洗机构供应清洗液，所述驱动装置驱动所述管口刮贝机构做直线往复运动以便刮除卡在换热管管口处的贝类，所述驱动装置驱动所述换热管喷洗机构做直线往复运动以便向各排换热管喷入清洗液；本发明还提供了一种利用海水冷却机组凝汽器加药除贝在线清洗装置进行除贝清洗的方法。该海水冷却机组凝汽器加药除贝在线清洗装置和方法具有设计科学、除贝效率高、操作简单、实用性强的优点。