本发明公开了一种组合式滤筒硅藻土过滤机及其使用方法，主要解决现有过滤系统过滤效率低，反冲洗效果差的问题。该过滤系统包括双向硅藻土过滤机、助剂添加装置、五通阀、水泵、控制柜以及连接管道；所述双向硅藻土过滤机包括外壳，设置于外壳内多个横向排列连接的双向滤筒，以及设置于外壳内并位于双向滤筒两端的滤前水进水通道和滤后水出水通道。本发明中硅藻土过滤机改变原有板框式过滤器的结构，过滤腔体分为内腔和上下分配流量的外腔，以保证在连贯过滤的一个周期内实现双向过滤，和交替反冲洗，提高了污水的过滤效率和反冲洗的效果。因此，适宜推广应用。