本发明涉及一种运动导流尾翼总成装配工装，包括工装骨架，其特征是：在工装骨架上定位设置有对中/限位装置、定位基准套件、操纵装置和检测基准套件；工装骨架由前横梁、后横梁、左纵梁和右纵梁构成；对中/限位装置包括设在前横梁中部上的三连杆机构、左端部上的左侧限位机构、右端部上的右侧限位机构；三连杆机构由连杆支架、左连杆、中连杆和右连杆构成；左侧限位机构通过左侧滑轨组件配合连接在前横梁的左端部上并与三连杆机构的左连杆的左端连接；右侧限位机构通过右侧滑轨组件配合连接在前横梁的右端部上并与三连杆机构的右连杆的右端连接。其能确保运动导流尾翼的X向和Y向在相对背门处于外观理论位置的姿态下进行螺栓紧固。