本发明提供一种管井封堵结构及方法，涉及管井封堵技术领域，结构包括下箱体和上箱体，下箱体包括设置于两个下柱梁之间的支撑板以及设置于支撑板上方的岩棉填充层，上箱体包括设置于两个上柱梁之间的支模板、设置于支模板上方的混凝土层以及设置于混凝土层上方的防水层，支撑板与通过连接螺丝与下柱梁底部连接，支模板与上柱梁底部连接，上柱梁侧壁设置有连接角铁，连接角铁上设置有钢筋网。本发明一种管井封堵结构及方法结构简单，在箱体建筑中箱体与箱体连接位置进行管井封堵，封堵效果好，防水防鼠能力强，由于与箱体建筑配合，封井速度快，安全性好。