本发明涉及一种无线水生生物监测系统及方法，该系统包括：探头电路基板、主控电路基板、供电模块、外部通信模块和终端设备。所述探头电路基板，包括红外发射单元、红外接收单元、位移检测模块和心率传感模块，用于采集水生生物血管容积在心动周期变化下的反射光信号和水生生物运动初始信号；所述主控电路基板，包括主控模块和无线通信模块；所述供电模块，用于为所述探头电路基板和主控电路基板提供电源；所述外部通信模块，用于接收所述无线通信模块传输的心率信息、位移活动信息和预警指令并输出；所述终端监控设备，用于接收、保存并显示外部通信模块输出的所述心率信息、位移活动信息和预警指令，并根据预警指令做出预设警示响应。本发明实现了水生生物活动信号的探测和运算处理的各个模块封装集成化，通过无线通信模块实现数据从水下到空气的无线实时传输，打破了传统水生生物活动信号监测“有线测量”的局限性。