本发明涉及一种道岔钢轨自动除锈喷涂系统及方法，该系统包括输送线、锯钢轨表面除锈抛丸机、表面清洁装置、喷漆房、烘干房、废气处理装置、钢轨移栽机构和下料机构。该方法包括：(1)将钢轨工件放置在上料输送线上；(2)运至锯钢轨表面除锈抛丸机内进行抛丸除锈处理；(3)通过表面除锈清洁输送线运至表面清洁装置内进行深层清洁；(4)运入喷漆房内喷漆；(5)运至烘干房内烘干处理，再通过钢轨移栽机构将烘干的钢轨工件运至出料输送线；(6)下料机构下料。本发明能实现钢轨表面的快速除锈及全断面涂装，除锈后钢轨能够达到一定的光洁度，实现较好的除锈效果，满足钢轨涂装的要求，涂装后钢轨能达到一定的防腐效果，满足工艺要求。