本发明公开了一种区域备用辅助服务交易方法及系统，所述方法包括计算省级电网次日备用容量裕度参考值，并下发至各省级电网调度机构；完成联络线日前计划更新和下发，将日前备用市场出清结果发布至市场主体；经过对日前机组可售容量进行合理性和安全性校验，形成次日全网日内可用上调机组序列，并向市场主体发布次日日内备用价格指数和全网次日日内可用上调机组序列；接收滚动上报的省级电网日内初始发电计划周期；完成联络线日内计划更新和下发，并将日内备用市场出清结果发布至市场主体，本发明通过建立市场化的备用辅助服务跨省调剂机制，充分发挥市场在资源配置中的决定性作用，全面提升区域电网电力安全保障能力。