本发明公开了一种独立分控式核酸样本保存箱，包括箱体和管体，所述箱体的底部设有控制模组所述箱体上开设有存放部，所述存放部的底部固定安装有支撑筒，所述支撑筒的外侧通过轴承转动支撑有转筒，所述转筒与存放部内壁滑动接触，所述转筒内设置有紧固装置，所述转筒内设置有承载板，所述承载板下表面固定连接有螺纹杆。在插入管体时，弹性拨板与管体之间的摩擦力会使螺纹端与螺纹盖连接更加紧密，以避免螺纹盖未完全拧紧；能间歇性检测样本保存液是否变质；当样本保存液出现泄露时，能及时警示人们进行清理；每个管体都处于独立的存放部内，可以设置不同的保存温度，取出其中一个管体时不会影响其他管体的保存。