本公开实施例是关于一种水体衰减系数测量系统，包括：发射部，发射部设置在水面之上，用于向水体发射预设波长的光信号；多个出射部和多个水下收发部，均设置在水下，多个出射部用于将发射部发射的光信号向水下收发部进行发射；多个水下收发部将接收到的光信号进行处理并生成水体衰减系数测量系统的相关数据，然后通过光信号返回给出射部；水上接收部用于接收自水下收发部返回的光信号并将其发送给处理部；处理部用于对水上接收部发出的光信号进行处理；其中，多个出射部设置于水下预设的多个深度。本实施例中，利用该水体衰减系数测量系统可以计算得出不同深度的水体衰减系数，系统测量广泛，测量精度高，可实现单波长或多波长测量。