本发明公开了复合式生态循环种养殖系统。本发明中，玻璃缸鱼缸养殖区排放的尾水经微生物处理后，进入蔬菜栽培系统，再经蔬菜根系的生物吸收过滤，把处理后的废水返回至养殖池，没有废水的排放，既满足了高品质新鲜鱼类和蔬菜生产的需求，又避免了污染环境的养分流失；养殖尾水系统的内部利用有益菌调节水体中菌相藻相的平衡，防止残饵与代谢产物积累所引起的水体环境的恶化，杆菌的作用就是防止粪便、死藻、残饵的过度积累，促进藻相的更新，及时分解水中有机物，对池塘水质、底质的改良与修复效果十分明显，同时这种闭锁环工艺的复合系统可用于大规模生产，效率高，很大程度上减少水资源的使用。