本发明公开了一种风力发电系统的偏航与输出功率控制方法，其包括有如下逻辑：全自动启动控制逻辑，用于对风速进行检测，并且当实时风速符合预设的启动风速时启动风机；偏航控制逻辑，用于计算风向角与风机偏航角之差，并根据预设的偏航控制算法控制风轮的朝向，使得所述风轮正对风，进而获得最大功率；转速控制逻辑，用于当风速低于额定风速时，令桨距角保持为0°，同时进行转速控制，进而实现最大风能追踪，以及获得最大能量。本发明通过优化设计偏航控制程序和调整控制参数上下限，提高了风能有效转化利用率，同时，利用模糊控制方法解决了输出电压不稳定等问题，大大减少了现场维护工作量，较好地满足了应用需求。